Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbsnQ8CIT9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SbsnQ8CIT9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbsnQ8CIT9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbsnQ8CIT9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbsnQ8CIT9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbsnQ8CIT9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbsnQ8CIT9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbsnQ8CIT9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbsnQ8CIT9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbsnQ8CIT9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbsnQ8CIT9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbsnQ8CIT9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbsnQ8CIT9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbsnQ8CIT9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SbsnQ8CIT9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbsnQ8CIT9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbsnQ8CIT9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbsnQ8CIT9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbsnQ8CIT9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbsnQ8CIT9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbsnQ8CIT9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbsnQ8CIT9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbsnQ8CIT9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbsnQ8CIT9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbsnQ8CIT9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SbsnQ8CIT9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SbsnQ8CIT9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SbsnQ8CIT9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SbsnQ8CIT9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SbsnQ8CIT9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SbsnQ8CIT9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms