Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mterf1aQ8CHZ9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms