Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms