Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF7

Tcerg1, Transcription elongation regulator 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcerg1Q8CGF7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcerg1Q8CGF7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tcerg1Q8CGF7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tcerg1Q8CGF7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcerg1Q8CGF7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcerg1Q8CGF7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcerg1Q8CGF7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcerg1Q8CGF7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcerg1Q8CGF7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcerg1Q8CGF7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcerg1Q8CGF7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcerg1Q8CGF7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcerg1Q8CGF7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcerg1Q8CGF7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcerg1Q8CGF7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcerg1Q8CGF7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcerg1Q8CGF7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcerg1Q8CGF7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcerg1Q8CGF7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcerg1Q8CGF7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcerg1Q8CGF7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcerg1Q8CGF7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcerg1Q8CGF7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcerg1Q8CGF7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcerg1Q8CGF7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcerg1Q8CGF7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcerg1Q8CGF7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcerg1Q8CGF7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcerg1Q8CGF7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcerg1Q8CGF7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcerg1Q8CGF7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcerg1Q8CGF7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcerg1Q8CGF7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcerg1Q8CGF7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcerg1Q8CGF7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcerg1Q8CGF7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcerg1Q8CGF7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcerg1Q8CGF7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcerg1Q8CGF7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcerg1Q8CGF7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcerg1Q8CGF7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms