Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms