Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc28bQ8CEG5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc28bQ8CEG5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms