Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc17Q8CE13 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms