Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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