Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atg4aQ8C9S8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg4aQ8C9S8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg4aQ8C9S8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Atg4aQ8C9S8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg4aQ8C9S8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Atg4aQ8C9S8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Atg4aQ8C9S8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Atg4aQ8C9S8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg4aQ8C9S8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg4aQ8C9S8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Atg4aQ8C9S8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg4aQ8C9S8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg4aQ8C9S8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Atg4aQ8C9S8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Atg4aQ8C9S8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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