Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7G5

Apoa5, Apolipoprotein A-V, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa5Q8C7G5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa5Q8C7G5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa5Q8C7G5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa5Q8C7G5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa5Q8C7G5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa5Q8C7G5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa5Q8C7G5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa5Q8C7G5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa5Q8C7G5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa5Q8C7G5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa5Q8C7G5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa5Q8C7G5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa5Q8C7G5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa5Q8C7G5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa5Q8C7G5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa5Q8C7G5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa5Q8C7G5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa5Q8C7G5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa5Q8C7G5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa5Q8C7G5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa5Q8C7G5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa5Q8C7G5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa5Q8C7G5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa5Q8C7G5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa5Q8C7G5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa5Q8C7G5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa5Q8C7G5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa5Q8C7G5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa5Q8C7G5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa5Q8C7G5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa5Q8C7G5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa5Q8C7G5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa5Q8C7G5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa5Q8C7G5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa5Q8C7G5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa5Q8C7G5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa5Q8C7G5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa5Q8C7G5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa5Q8C7G5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa5Q8C7G5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoa5Q8C7G5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoa5Q8C7G5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoa5Q8C7G5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms