Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot2Q8C5L3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms