Protein–RNA interactions for Protein: Q8C570

Rae1, mRNA export factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rae1Q8C570 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rae1Q8C570 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms