Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms