Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3B8

Rft1, Protein RFT1 homolog, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rft1Q8C3B8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rft1Q8C3B8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rft1Q8C3B8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rft1Q8C3B8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rft1Q8C3B8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rft1Q8C3B8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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