Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B2

Tiparp, TCDD-inducible poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TiparpQ8C1B2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TiparpQ8C1B2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms