Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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