Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctdsp2Q8BX07 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ctdsp2Q8BX07 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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