Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWQ6

UPF0505 protein C16orf62 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BWQ6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8BWQ6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms