Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU7

Rccd1, RCC1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rccd1Q8BTU7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rccd1Q8BTU7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms