Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms