Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP99

UPF0500 protein C1orf216 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BP99 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8BP99 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8BP99 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8BP99 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8BP99 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q8BP99 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q8BP99 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8BP99 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8BP99 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8BP99 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8BP99 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8BP99 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8BP99 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8BP99 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8BP99 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8BP99 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8BP99 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8BP99 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8BP99 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8BP99 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8BP99 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8BP99 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8BP99 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8BP99 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8BP99 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8BP99 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8BP99 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8BP99 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8BP99 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8BP99 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8BP99 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8BP99 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8BP99 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8BP99 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8BP99 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8BP99 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8BP99 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8BP99 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8BP99 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8BP99 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8BP99 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8BP99 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8BP99 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8BP99 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8BP99 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8BP99 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8BP99 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8BP99 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8BP99 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8BP99 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8BP99 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8BP99 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8BP99 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8BP99 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8BP99 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8BP99 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8BP99 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8BP99 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8BP99 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8BP99 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8BP99 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8BP99 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8BP99 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8BP99 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8BP99 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8BP99 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8BP99 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8BP99 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8BP99 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8BP99 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8BP99 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8BP99 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8BP99 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8BP99 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8BP99 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8BP99 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8BP99 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8BP99 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8BP99 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8BP99 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8BP99 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8BP99 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8BP99 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8BP99 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8BP99 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8BP99 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8BP99 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8BP99 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8BP99 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8BP99 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8BP99 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8BP99 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8BP99 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8BP99 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8BP99 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8BP99 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8BP99 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8BP99 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8BP99 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8BP99 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms