Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcal1Q8BJL0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcal1Q8BJL0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcal1Q8BJL0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcal1Q8BJL0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcal1Q8BJL0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcal1Q8BJL0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcal1Q8BJL0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcal1Q8BJL0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcal1Q8BJL0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcal1Q8BJL0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcal1Q8BJL0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcal1Q8BJL0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Smarcal1Q8BJL0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smarcal1Q8BJL0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms