Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra5Q8BHJ7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms