Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4dQ8BGV9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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