Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms