Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Katnb1Q8BG40 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Katnb1Q8BG40 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Katnb1Q8BG40 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Katnb1Q8BG40 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Katnb1Q8BG40 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Katnb1Q8BG40 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Katnb1Q8BG40 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Katnb1Q8BG40 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Katnb1Q8BG40 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Katnb1Q8BG40 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Katnb1Q8BG40 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Katnb1Q8BG40 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Katnb1Q8BG40 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Katnb1Q8BG40 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Katnb1Q8BG40 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Katnb1Q8BG40 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Katnb1Q8BG40 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Katnb1Q8BG40 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Katnb1Q8BG40 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Katnb1Q8BG40 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Katnb1Q8BG40 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Katnb1Q8BG40 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Katnb1Q8BG40 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Katnb1Q8BG40 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Katnb1Q8BG40 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Katnb1Q8BG40 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Katnb1Q8BG40 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Katnb1Q8BG40 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Katnb1Q8BG40 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Katnb1Q8BG40 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Katnb1Q8BG40 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Katnb1Q8BG40 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms