Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW6

H2-M10.3, Histocompatibility 2, M region locus 10.3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.3Q85ZW6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.02■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.02■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-M10.3Q85ZW6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 210.2 ms