Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srgap3Q812A2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms