Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms