Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms