Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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