Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5bQ80Y84 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms