Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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