Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nrde2Q80XC6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrde2Q80XC6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrde2Q80XC6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrde2Q80XC6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrde2Q80XC6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrde2Q80XC6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrde2Q80XC6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrde2Q80XC6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrde2Q80XC6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrde2Q80XC6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrde2Q80XC6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrde2Q80XC6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrde2Q80XC6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrde2Q80XC6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrde2Q80XC6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrde2Q80XC6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrde2Q80XC6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrde2Q80XC6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrde2Q80XC6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrde2Q80XC6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrde2Q80XC6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrde2Q80XC6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrde2Q80XC6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrde2Q80XC6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrde2Q80XC6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrde2Q80XC6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrde2Q80XC6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrde2Q80XC6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrde2Q80XC6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrde2Q80XC6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrde2Q80XC6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrde2Q80XC6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrde2Q80XC6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms