Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
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Zbed4Q80WQ9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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Zbed4Q80WQ9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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Zbed4Q80WQ9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Zbed4Q80WQ9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Zbed4Q80WQ9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Zbed4Q80WQ9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Zbed4Q80WQ9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Zbed4Q80WQ9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Zbed4Q80WQ9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Zbed4Q80WQ9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Zbed4Q80WQ9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Zbed4Q80WQ9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed4Q80WQ9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms