Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ell3Q80VR2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ell3Q80VR2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ell3Q80VR2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ell3Q80VR2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ell3Q80VR2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ell3Q80VR2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ell3Q80VR2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ell3Q80VR2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ell3Q80VR2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ell3Q80VR2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ell3Q80VR2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ell3Q80VR2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ell3Q80VR2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ell3Q80VR2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ell3Q80VR2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ell3Q80VR2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ell3Q80VR2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ell3Q80VR2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ell3Q80VR2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ell3Q80VR2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ell3Q80VR2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ell3Q80VR2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ell3Q80VR2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ell3Q80VR2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ell3Q80VR2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ell3Q80VR2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ell3Q80VR2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ell3Q80VR2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ell3Q80VR2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ell3Q80VR2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ell3Q80VR2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ell3Q80VR2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ell3Q80VR2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ell3Q80VR2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ell3Q80VR2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ell3Q80VR2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ell3Q80VR2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ell3Q80VR2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ell3Q80VR2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ell3Q80VR2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ell3Q80VR2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms