Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms