Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cdc42bpbQ7TT50 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdc42bpbQ7TT50 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms