Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atf7ipQ7TT18 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atf7ipQ7TT18 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atf7ipQ7TT18 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atf7ipQ7TT18 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atf7ipQ7TT18 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atf7ipQ7TT18 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Atf7ipQ7TT18 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atf7ipQ7TT18 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atf7ipQ7TT18 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atf7ipQ7TT18 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atf7ipQ7TT18 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atf7ipQ7TT18 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atf7ipQ7TT18 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atf7ipQ7TT18 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atf7ipQ7TT18 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atf7ipQ7TT18 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atf7ipQ7TT18 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atf7ipQ7TT18 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atf7ipQ7TT18 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Atf7ipQ7TT18 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atf7ipQ7TT18 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms