Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccp110Q7TSH4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccp110Q7TSH4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccp110Q7TSH4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccp110Q7TSH4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccp110Q7TSH4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccp110Q7TSH4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccp110Q7TSH4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms