Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf516Q7TSH3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf516Q7TSH3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf516Q7TSH3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf516Q7TSH3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf516Q7TSH3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf516Q7TSH3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf516Q7TSH3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf516Q7TSH3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf516Q7TSH3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf516Q7TSH3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf516Q7TSH3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf516Q7TSH3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf516Q7TSH3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf516Q7TSH3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf516Q7TSH3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf516Q7TSH3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf516Q7TSH3 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf516Q7TSH3 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf516Q7TSH3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf516Q7TSH3 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf516Q7TSH3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf516Q7TSH3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf516Q7TSH3 Olfr886-ps1-201ENSMUST00000212395 708 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf516Q7TSH3 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf516Q7TSH3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf516Q7TSH3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf516Q7TSH3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf516Q7TSH3 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf516Q7TSH3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf516Q7TSH3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf516Q7TSH3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf516Q7TSH3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf516Q7TSH3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf516Q7TSH3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Znf516Q7TSH3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Znf516Q7TSH3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf516Q7TSH3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms