Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms