Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK1

Rfx4, Transcription factor RFX4, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx4Q7TNK1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx4Q7TNK1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx4Q7TNK1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx4Q7TNK1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx4Q7TNK1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx4Q7TNK1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx4Q7TNK1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx4Q7TNK1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx4Q7TNK1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx4Q7TNK1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx4Q7TNK1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms