Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sbno2Q7TNB8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms