Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Shq1Q7TMX5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms