Protein–RNA interactions for Protein: Q7TM95

Tigd3, Tigger transposable element-derived protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd3Q7TM95 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tigd3Q7TM95 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms