Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Y2

Sox11, Transcription factor SOX-11, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox11Q7M6Y2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox11Q7M6Y2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox11Q7M6Y2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox11Q7M6Y2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox11Q7M6Y2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox11Q7M6Y2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox11Q7M6Y2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox11Q7M6Y2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox11Q7M6Y2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox11Q7M6Y2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox11Q7M6Y2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox11Q7M6Y2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox11Q7M6Y2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox11Q7M6Y2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox11Q7M6Y2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox11Q7M6Y2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox11Q7M6Y2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox11Q7M6Y2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox11Q7M6Y2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox11Q7M6Y2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox11Q7M6Y2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox11Q7M6Y2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox11Q7M6Y2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox11Q7M6Y2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox11Q7M6Y2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox11Q7M6Y2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox11Q7M6Y2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox11Q7M6Y2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox11Q7M6Y2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox11Q7M6Y2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox11Q7M6Y2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox11Q7M6Y2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox11Q7M6Y2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms