Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc6aQ78XR0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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