Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms