Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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